SEARCH
JASPAR matrix models:
ID name species class family Sequence logo
MA0010.1  br_Z1  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0011.1  br_Z2  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0012.1  br_Z3  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0013.1  br_Z4  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0015.1  Cf2_II  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0016.1  usp  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  Hormone-nuclear Receptor 
MA0022.1  dl_1  Drosophila melanogaster   Ig-fold  Rel 
MA0023.1  dl_2  Drosophila melanogaster   Ig-fold  Rel 
MA0026.1  Eip74EF  Drosophila melanogaster   Winged Helix-Turn-Helix  Ets 
MA0049.1  hb  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0085.1  Su(H)  Drosophila melanogaster   Other  LAG1 
MA0086.1  sna  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0126.1  ovo  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0165.1  Abd-B  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0166.1  Antp  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0167.1  Awh  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0168.1  B-H1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0169.1  B-H2  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0170.1  C15  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0171.1  CG11085  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0172.1  CG11294  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0173.1  CG11617  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0174.1  CG42234  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0175.1  CG13424  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0176.1  CG15696  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0177.1  CG18599  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0178.1  CG32105  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0179.1  CG32532  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0180.1  Vsx2  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0181.1  Vsx1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0182.1  CG4328  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0183.1  CG7056  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0184.1  CG9876  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0185.1  Deaf1  Drosophila melanogaster   Other Alpha-Helix  Sand 
MA0186.1  Dfd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0187.1  Dll  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0188.1  Dr  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0189.1  E5  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0190.1  Gsc  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0191.1  HGTX  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0192.1  Hmx  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0193.1  Lag1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0194.1  Lim1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0195.1  Lim3  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0196.1  NK7.1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0197.1  Oct  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0198.1  OdsH  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0199.1  Optix  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0200.1  Pph13  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0201.1  Ptx1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0202.1  Rx  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0203.1  Scr  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0204.1  Six4  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0205.1  Trl  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0206.1  abd-A  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0207.1  achi  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0208.1  al  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0209.1  ap  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0210.1  ara  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0211.1  bap  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0212.1  bcd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0213.1  brk  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Brinker 
MA0214.1  bsh  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0215.1  btn  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0217.1  caup  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0218.1  ct  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0219.1  ems  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0220.1  en  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0221.1  eve  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0222.1  exd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0224.1  exex  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0225.1  ftz  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0226.1  hbn  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0227.1  hth  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0228.1  ind  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0229.1  inv  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0230.1  lab  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0231.1  lbe  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0232.1  lbl  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0233.1  mirr  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0234.1  oc  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0235.1  onecut  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0236.1  otp  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0238.1  pb  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0239.1  prd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0240.1  repo  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0241.1  ro  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0242.1  run::Bgb  Drosophila melanogaster   Ig-fold  Runt 
MA0243.1  sd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0244.1  slbo  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0245.1  slou  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0246.1  so  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0248.1  tup  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0249.1  twi  Drosophila melanogaster   Zipper-type  Helix-Loop-Helix 
MA0250.1  unc-4  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0251.1  unpg  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0252.1  vis  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0253.1  vnd  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0254.1  vvl  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0255.1  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Zeste 
MA0256.1  zen  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0257.1  zen2  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0094.2  Ubx  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0443.1  btd  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0444.1  CG34031  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0445.1  Drosophila melanogaster   Other Alpha-Helix  High Mobility Group box (HMG) 
MA0446.1  fkh  Drosophila melanogaster   Winged Helix-Turn-Helix  Forkhead 
MA0447.1  gt  Drosophila melanogaster   Zipper-type  Leucine Zipper 
MA0448.1  H2.0  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0449.1  Drosophila melanogaster   Zipper-type  Helix-Loop-Helix 
MA0450.1  hkb  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0451.1  kni  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  Hormone-nuclear Receptor 
MA0453.1  nub  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0454.1  odd  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0456.1  opa  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0457.1  PHDP  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0458.1  slp1  Drosophila melanogaster   Winged Helix-Turn-Helix  Forkhead 
MA0459.1  tll  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  Hormone-nuclear Receptor 
MA0460.1  ttk  Drosophila melanogaster   Other  AT-hook 
MA0529.1  BEAF-32  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BED 
MA0216.2  CAD  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
MA0530.1  CNC::maf-S  Drosophila melanogaster   Zipper-Type  Leucine Zipper 
MA0531.1  CTCF  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0452.2  KR  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0532.1  STAT92E  Drosophila melanogaster   Ig-fold  Stat 
MA0533.1  SU(HW)  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  BetaBetaAlpha-zinc finger 
MA0534.1  EcR::usp  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  Hormone-nuclear Receptor 
MA0237.2  pan  Drosophila melanogaster   Other Alpha-Helix  High Mobility Group 
MA0535.1  Mad  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  MH1 
MA0536.1  pnr  Drosophila melanogaster   Zinc-coordinating  GATA 
MA0247.2  tin  Drosophila melanogaster   Helix-Turn-Helix  Homeo 
 
ANALYZE selected matrix models:
selected models using STAMP
Create RANDOM matrix models based on selected models
Number of matrices:    Format:
Create models with PERMUTED columns from selected:
Type: Format:
SCAN this (fasta-formatted) sequence with selected matrix models
Relative profile score threshold   %